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近年における生命科学分野の革新的進展は、考古学にも変革の波を押し寄せている。 パレオゲノミクス（＝古代ゲノム学）は、遺跡に埋まっている古人骨から大量のゲノム情報（被葬者個人に関する生前の遺伝情報）を抽出して、従来型の考古学研究では明確に可視化できなかった血縁関係、婚姻システム、社会構造、他地域社会との混血や融合といった諸相を科学的に解明しようとする分野である。かつてはミトコンドリアDNA配列の解析が限界であったが、今や古人骨中の微量DNAの抽出・解析技術の進展により全ゲノム解読が可能となり、得られる情報の質と量が全く異なる新段階となった。まさに時代は、新世代考古学の創成へと動いている。本研究は、世界遺産「コパンのマヤ遺跡」の王墓出土人骨を含む数百サンプルの古人骨から大量のゲノム情報を抽出・解析して、従来の研究では仮説にとどまっていた諸相（居住民の遺伝的起源、王朝の起源、他のマヤ王家との親族関係など）に斬りこみ、コパン王朝のダイナミクスを解明しようとする。